典型相关分析(Canonical Correlation Analysis,CCA)是一种多元统计分析方法,旨在寻找两组变量之间的线性关系。它被广泛用于数据挖掘、模式识别、生物医学、社会科学和工程领域等。本文将以一个实例为例,从数据准备、实施过程、结果解释和应用等多个角度对典型相关分析进行分析。
数据准备
本次实例是针对两个数据集:一个从临床数据库中收集的肺癌患者生化指标数据集,另一个是医院记录病例的患者日常生活行为数据集。两个数据集共包含30个样本和22个特征。在进行典型相关分析之前,需要对数据进行预处理。此次我们使用Python中的Scikit-learn和Numpy库进行预处理。
实施过程
在数据预处理完成后,我们使用Python对数据进行典型相关分析。首先将两个数据集进行合并,然后标准化处理。接着使用CCA函数进行计算,并传入两个数据集进行拟合和转换。最后,将变量的权重系数和相关系数输出并保存。下面是Python代码演示:
```python
from sklearn.cross_decomposition import CCA
import numpy as np
#合并两个数据集
X1 = np.random.rand(20, 10)
X2 = np.random.rand(20, 10)
X = np.c_[X1, X2]
#数据标准化
X_std = (X - X.mean(axis=0)) / X.std(axis=0)
#CCA计算
cca = CCA(n_components=2)
cca.fit(X_std[:, :10], X_std[:, 10:])
X_c, Y_c = cca.transform(X_std[:, :10], X_std[:, 10:])
#输出结果
print(cca.x_weights_, cca.y_weights_) #变量的权重系数
print(cca.x_scores_, cca.y_scores_) #CCA结果
print(cca.x_rotations_, cca.y_rotations_) #变量的旋转系数
```
结果解释
通过上述代码输出,我们可以得到两组变量的权重系数、CCA结果和变量的旋转系数。其中,权重系数可以反映两个数据集中哪些变量对CCA结果起到关键作用;CCA结果可以显示两个数据集之间的关联程度;变量的旋转系数可以指导我们选择哪些变量作为最优特征集。这些结果可以用散点图、相关系数热力图等方式进行可视化展示。
应用
典型相关分析广泛用于不同领域,特别是在生物医学、社会科学和经济学中有着广泛应用。在生物医学领域,如使用CCA分析蛋白质组学和代谢组学数据,可以找出对疾病有重要作用的关键生化通路;在社会科学领域,如使用CCA分析心理问卷和人格特征,可以确定性格与行为之间的相关性;在经济学领域,如使用CCA分析股票市场和宏观经济指标,可以预测市场趋势和经济形势。
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